En paralelo a las Actividades Formativas, el alumno desarrollará individualmente un trabajo original de investigación bajo la dirección de un director de tesis, asignado entre el claustro del programa DOSIC por su Comisión Académica.

Cada uno de los profesores del claustro pertenece a uno de los grupos de investigación asociados al programa. Consecuentemente, cada doctorando realizará su trabajo doctoral en el seno de uno de dichos grupos de I+D.

Una vez admitido en el Programa, y superadas en caso de haberse requerido, los complementos formativos, el alumno iniciará el programa doctoral. Para todo ello, dispondrá de un plazo límite de 3 años, si está en régimen de dedicación completa, o de 5 años si solicita un régimen de dedicación parcial por razones laborales, que deberá justificar debidamente.

Durante este período la Comisión Académica de DOSIC asignará a cada doctorando un tutor, que será el encargado de supervisar y orientar al alumno. También será el responsable de la tutela de las actividades formativas a desarrollar.

Durante el periodo doctoral el alumno realizará:

1. Unas actividades formativas con una dedicación investigadora equivalente de 450 horas durante todo el período doctoral. La Comisión Académica evaluará anualmente estas actividades.
2. Una investigación original que culminará con la presentación de una tesis doctoral. Al comienzo el doctorando presentará una propuesta razonada y documentada de línea de investigación, que la Comisión Académica aprobará, asignando para su desarrollo un director entre el claustro académico de DOSIC. En casos excepcionales, cuando la investigación lo requiera, se podrá asignar un co-director.

Cada año la Comisión Académica evaluará el progreso de cada alumno, valorando tanto las actividades formativas como el progreso de la investigación doctoral, emitiendo un informe personal. Si el informe no fuera positivo el alumno no podrá continuar en el Programa.